
2024年7月,安徽医科大学刘业海等团队在Molecular Cancer(IF=27.7)上发表了“A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression”的研究论文。该论文首次揭示了PFKP /c-Myc正反馈通路在HNSCC的恶性进展中发挥重要作用,同时靶向PFKP和c-Myc是一种新的HNSCC的有效治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了淀粉酶互作组查重服务项目,助力发现PFKP可能在HNSCC的进展过程中与ERK2相互作用,从而激活MAPK/ERK通路。
汉语一级标题:PFKP和c-Myc之间的正反馈通路促进头颈部鳞状细胞癌的进展
发布中文核心期刊:Molecular Cancer
关系成分:27.7
公布时光:2024年7月
我公司:安徽医科大学
拜谱提供数据技术性:淀粉酶互作组
技术工艺路线图:
论述数据
1.PFKP与ERK2相护帮助,系统激活MAPK/ERK信号通路
前期的qRT-PCR和免疫印迹实验结果表明PFKP在肿瘤组织中高表达,并与HNSCC患者预后不良相关,通过PFKP敲低及过表达的体内体外实验表明PFKP促进HNSCC患者的肿瘤发展。为了探究PFKP促进肿瘤发展的机制,使用PFKP敲低的细胞和对照组进行了转录组分析,共筛选出2019个差异基因,其中906个上调,1113个下调(图1A)。差异基因的KEGG富集分析发现,MAPK途径是PFKP抑制后显著改变的途径之一(图1B),ERK途径是所有MAPK信号转导途径中最重要的信号级联,在肿瘤细胞的生存和发展中起着至关重要的作用。ERK级联的激活在各种癌症类型中普遍存在,超过90%的HNSCC患者存在磷酸化的ERK1/2 (p-ERK1/2)。结果表明,细胞中PFKP的敲低导致p-ERK1/2水平降低,而PFKP的过表达导致p-ERK1/2水平升高(图1C)。通过蛋白酶互作组检则、IF测定、CoIP 测定证明PFKP可能在HNSCC的进展过程中与ERK2相互作用(图1D-1H),确定了PFKP和ERK2之间的结合区域位于氨基酸412-784(图1J)。通过分子对接和CoIP检测表明了PFKP与ERK2结合的特定残基为K753。这些数据表明 PFKP 可能在 HNSCC 的进展过程中与 ERK2 相互作用。
图1 PFKP采用ERK2成功激活MAPK/ERK径路
2.PFKP完成更改密码ERK通道来增加c-Myc蛋白质的稳定的性
TCGA的GSEA数据显示,HNSCC中PFKP高表达组Myc信号所靶向的基因存在富集(图2A)。与p-ERK1/2水平一致,观察到PFKP敲低的细胞中c-Myc和p-S62-Myc水平显著降低,细胞过表达PFKP导致c-Myc和p-S62-Myc的上调(图2B)。免疫荧光实验证实了PFKP对c-Myc的正调控作用(图2C)。然而qRT-PCR结果显示,PFKP对c-Myc的调控不在mRNA转录水平(图2D-E)。研究团队通过CHX(环己酰亚胺)追踪分析检测蛋白质稳定性,与对照组相比,PFKP敲低的细胞中c-Myc的降解显著加速(图2G-H)。此外,MG132预处理可以抑制PFKP耗竭引起的c-Myc的加速降解(图2F)。泛素化定性分析揭示,PFKP的丢失有利于了c-Myc的泛素化和生物降解,即逝表答PFKP则压制了这一种方式(图2L-M)。这些发现支持以下结论:PFKP 可能与 ERK2 相互作用,通过抑制泛素介导的 c-Myc 降解而上调 c-Myc。
图2 PFKP有助于了ERK介导的c-Myc的安稳性
3.c-Myc力促HNSCC中PFKP的转录
在PFKP敲低的神经血细胞系中过证明c-Myc,最终结论显视,过证明c-Myc可逆了PFKP敲低面对神经血细胞系繁衍、淋巴腺管形成、转至和侵扰的抑止效应。PFKP可以用增強c-Myc证明驱动HNSCC最新动态、生长期和转回。是为了进一部研究性学习c-Myc调节管控PFKP转录的策略,用生物工程信息内容学、TCGA-HNSCC统计大资料及K-M繁衍具体阐述阐述,转录系数c-Myc与PFKP呈正相应的。发源公用统计大资料表的ChIP-seq和RNA-seq统计大资料显视,c-Myc在PFKP的起动子地域更具显电磁波,有时候淋巴腺瘤神经血细胞系中c-Myc可以减少后PFKP mRNA的水平证明量有比较突出大大减少(图3A-F)。运用JASPAR(转录系数預测统计大资料表)預测具体阐述,位点甲基化及ChIP-qRT-PCR最终结论证明c-Myc 可以用间接组合 PFKP 的起动子来转录调整 PFKP(图3G-K)。抗体组化染色剂最终结论显视,与PFKP相符,c-Myc在癌集体中的证明低过其联接的普通集体,有时候PFKP和c-Myc高证明的HNSCC病员的总繁衍期比较突出更差(图3L-P)。c-Myc可以用组合PFKP基因组的起动子调整PFKP的转录,PFKP和c-Myc都可以与HNSCC的继发性有关的。
图3 c-Myc促进PFKPDNA的转录
4.靶点 PFKP 和 c-Myc 抑制作用 HNSCC 癌症进行
的学术研究适用HNSCC PDO3d模型风险评估了PFKP压药药物注射剂(PFKP siRNA)与c-Myc压药药物注射剂(10,058-F4)协力治療的的疗效。结论体现,PFKP和c-Myc的协力压制比单压药药物注射剂治療更效果地压制HNSCC PDO的植物的生长(图4A-H)。
图4 靶点 PFKP 和 c-Myc 抑制性 HNSCC 肉瘤进步
软文总结ppt
本研究利用转录组、血清互作组、免疫共沉淀和CAM实验等分子生物学和细胞生物学技术对前期构建的HNSCC细胞系、类器官、PDX模型及120例临床样本进行了深入研究,同时结合生信分析,发现HNSCC患者组织和细胞中PFKP表达水平明显升高,并与患者的预后呈负相关;敲低PFKP显著抑制了HNSCC的增殖、血管生成以及转移。进一步研究发现,PFKP凭借融入ERK2抑止c-Myc的泛素化挥发,导致提高网站HNSCC的梭形细胞肿瘤新况。此外,c-Myc作为转录因子促进PFKP的转录,同时靶向PFKP和c-Myc治疗HNSCC模型取得更好的肿瘤抑制效果(图5)。
图5 PFKP和c-Myc组成的信息反馈二次回路,增进HNSCC增值能力、微血管生产和适当转移
拜谱个人心得体会
本研究旨在评估和验证PFKP和c-Myc在HNSCC肿瘤与邻近正常组织中的表达模式,探讨其对HNSCC临床特征的影响,并确定PFKP和c-Myc之间的正反馈回路在HNSCC进展中的功能作用和潜在机制。拜谱生物工程为本研究提供了蛋白质互作组拜谱生物,拜谱生物已研发完成并建立了完善成熟的转录组学、球淀粉酶组学、装饰球淀粉酶组学、新陈代谢组学以及两组学整合服务技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参看论文资料: Liu W, Ding Z, Tao Y, Liu S, Jiang M, Yi F, Wang Z, Han Y, Zong H, Li D, Zhu Y, Xie Z, Sang S, Chen X, Miao M, Chen X, Lin W, Zhao Y, Zheng G, Zafereo M, Li G, Wu J, Zha X, Liu Y. A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression. Mol Cancer. 2024 Jul 9;23(1):141. doi: 10.1186/s12943-024-02051-6. PMID: 38982480; PMCID: PMC11232239