
2024年9月由南京市农产品加工二本大学张万刚教学精英团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱微生物为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文字幕微信标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2025年导致指数公式:5.7
撤稿日期:2024年9月
潜在客户工作单位:南京农业大学
论述相关材料:蛋白
拜谱带来的技术:亚硝基化修饰组学
水平自驾线路:
一、科学研究后果
01.Caspase-3活力性
近几年尚不清NO对caspase-3的促使功效能不归因于NO介导的S-亚硝基化,各种不同有机废气浓度等度的GSNO做为外源性NO供应商,以引诱caspase-3的身体之外S-亚硝基化。结局证明,与无GSNO的组差距,100、200和400μM GSNO组的caspase-3亲水性显著性影响(图1),与事先有关报道共同。GSNO进行处理影响caspase-3亲水性的内在的现象仍急待确立。
图1 不一样含量的GSNO正确处理对caspase-3可溶性的引响
02.Caspase-3的S-亚硝基化的情况
深入分析Caspase-3的亚硝基化状态,以阐释GSNO对Caspase-3的反应迟钝性。经GSNO治疗后,检侧工具到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化难度增强(图2)。等等结果显示表达,外源性GSNO训练可顺利引导caspase-3的离体S-亚硝基化。从未有过大吃一惊的是,在不GSNO有着的照表组中检侧工具到同一个微亮的S-亚硝基化带,这表达caspase-3有可能有内源性的S-亚硝基化。因此,本深入分析中caspase-3的S-亚硝基化状态较高,而caspase-3的可溶性调低,这与以后的深入分析一样的。但,caspase-3的特男人S-亚硝基化呈现位点尚不清除,还必须要 进一点的研究。
图2 GSNO处置对caspase-3S-亚硝基化横向的印象
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。颜色标识的队列表现法S-亚硝基化肽,黑色标识的C表现法S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3光降解结蛋白酶
结蛋清质酶作为一个一款比较关键性的组织骨架蛋清质酶,在稳定肌组织组成的组成详细性和内缩性各方面起着比较关键性效果,设计S-亚硝基化caspase-3对结蛋清质酶光挥发的过敏性具备有比较关键性重大意义。与Std(未用胱天蛋清质酶酶-3和GSNO孵育的原始肌人造植物纤维蛋清质酶)组不同于,0 μM GSNO组(肌原人造植物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的详细结蛋清质酶量相关系数减小,显示caspase-3对结蛋清质酶具备有风险的蛋清质酶油脂水解意识。在GSNO孵育后,详细结蛋清质酶的量显著的增强(P < 0.05)。虽然,当GSNO盐浓度上升时,详细结蛋清质酶的量连续上涨(P < 0.05)(图5)。某一发现了认为,SNO淡化的caspase-3以程度依赖于的习惯调控结蛋清质酶的光挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3可降解肌钙蛋白质-T
肌钙淀粉酶-T (TnT)是原肌球淀粉酶调有担当腹肌收宿的丝条的都要肌原弹性植物人造纤维淀粉酶。TnT的溶解特征英文是测量工具到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化标准下,caspase-3对TnT的溶解情况下就像文中6如下,与Std组(未caspase-3和GSNO的肌原弹性植物人造纤维)好于,caspase-3组中30 kDa TnT电影情节不错增多,意味着caspase-3直接参与了TnT的溶解,于此,caspase-3与GSNO的孵育会造成30 kDa TnT上升。在100和200 μM GSNO组直接未测量工具到比较明显的性别差异(P > 0.05),而当GSNO的有机废气浓度以达到400 μM 时,该电影情节不错减低(P < 0.05)。他们看见意味着了SNO体现的caspase-3对TnT溶解的可抑拍摄用。结淀粉酶和TnT是caspase-3的敏感脆弱底物,而GSNO治理 消减caspase-3的催化吸附性已经会造成肌原弹性植物人造纤维淀粉酶溶解数量消减。上面所论,NO诱导性的S-亚硝基化也可以能够体现半胱氨酸残基来调caspase-3的催化吸附性,借以进一点导致其对结淀粉酶和TnT的淀粉酶淀粉水解的能力,若想导致牛肉片茶叶品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙蛋白质-T
二、总结ppt
本调查目的一起探讨S-亚硝基化对caspase-3遮盖的干扰下列关于陆陆续续对鸡肉肌原棉纤维素休外化学降解的干扰。淀粉酶S-亚硝基化还可以遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,关键在于造成 caspase-3灵活性减少,进这一步调节了其对鸡肉肌原棉纤维素淀粉酶的淀粉酶水解反应效率。三、拜谱工作小结
研发方案运用了酶活校正,亚硝基化绘制组学分折,WB等验测方法,表明核球蛋清质S-亚硝基化行绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这会造成了caspase-3活力性的降底,齐头并进的一步抑制作用了其对鸡肉肌原棉纤维核球蛋清质的核球蛋清质油脂水解功能。本研发方案为表达核球蛋清质质亚硝基化对肉质地的调节管控措施出示一堆个新的画面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的淀粉酶质组学、修饰语淀粉酶质组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列的产品的产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total腐蚀抹除、存在巯基,欢迎大家咨询!
符合专著:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663