
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力聚集MHC和紧密结合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免役肽字段同时译文资料后表达信心,提高基因测序的真实度,并采用De novo从后测序技术水平,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多样的资料介绍游戏内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌肿抗原的手段
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例解析
01 机能探索
论文主题 :The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发稿异物:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一个种核的输出淀粉酶,在肠癌中隔三差五过展现,逐项为肉瘤发生了的带动重要因素。当今,靶向治疗XPO1的小碳原子正被做为监床治疗癌症性药物。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 某种起源XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 癌症-免疫细胞中药治疗
软文选择题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
先生发表异物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)一种种生存率欠佳的侵蚀性肉瘤。根据目前有的诊疗设计由于缺乏明确疗效,因迫在眉睫需求新的诊疗方案。基于其T组织细胞侵润,做者假如说MPM一种个应该的诊疗性癌症晚期防疫针的阶段目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用研究背景质谱的抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶意胸膜间皮瘤免疫力肽组学论文检测
03 沙门氏菌mRNA役苗开发设计
小文章主题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表过杂志社:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过特征提取质谱的免疫检测肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感柒的Hela上皮细胞膜和HCT-116上皮细胞膜中鉴定费MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
天然免役肽组学是淀粉酶质组学的一种更快进展的层次结构,它专注力于研究分析天然免役系統中由主要是组识相匹配性分手后复合体(MHC)或人类白血癌癌细胞核核抗原(HLA)氧分子呈递的天然免役肽。这一些天然免役肽是血癌癌细胞核核表皮呈递的肽段,才可以被T血癌癌细胞核核识別,然后促发天然免役表现。立于质谱的天然免役肽组学都已经 成為检验MHC淀粉酶呈递肽的金标准单位最简单的方法,才可以一直检验各种身理和病理学动态下各种组识和血癌癌细胞核核业务类型中的天然免役肽组,假如线下实体瘤或新冠病毒感然的血癌癌细胞核核。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的核蛋白组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的抗体肽组测试服务的,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,才可以合理且会具备免疫系统性肽回文序列,知道更加非典型示范免疫系统性肽,层层抓落实挑选出可信新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
对比文献综述
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y