众所周知，蛋白质是生命的物质基础，也是基因功能的执行者。而许多蛋白质前体是没有活性的，需要经过翻译后修饰（PTM）等复杂过程才具有生理功能，因此PTM已成为生物学研究中的重要内容。核蛋白棕榈酰化突显是作用最普遍的脂酰化修饰，影响约20%的蛋白组。然而由于一般的棕榈酰蛋白含量低，高特异性富集棕榈酰修饰困难等技术挑战，极大地阻碍了该领域的进一步研究。拜谱生物采用ABE结合质谱高通量方法，以无偏倚地感觉全部整个蛋清质组中的棕榈酰化，为各位科研工作者的研究带来“独特视角”，助力提升课题及文章水平。那么棕榈酰化参与调控哪些疾病过程的蛋白功能变化？该修饰有哪些重要的科研意义？以及该产品的特色优势，今天将为大家一一揭秘。

01 、可逆性的S-棕榈酰化突显

基本指的棕榈酰化（S-palmitoylation或S-acylation）为S-棕榈酰化，意思是棕榈酸和核膳食纤维半胱氨酸的巯基综合，成型不稳定性的硫酯键，这般棕榈酰化拥有可逆反应性，由棕榈酰基移动酶（PAT）和去棕榈酰化酶（APT）介导自我调节，中仅DHHC有的是个传统的重要性的PAT宗族。

图1 由DHHC和APT介导的可逆性S-棕榈酰化

（全部图片再编辑器，出自于：Thomas Lanyon-Hogg, et al., Trends Biochem Sci, 2017）

02 、棕榈酰化范围广体验身体阶段

近几天的综诉多方面列举了棕榈酰化血清质，还包括从卡子和电磁波血清质到阳离子管道和多巴胺肾上腺素受体，某些棕榈酰化血清质广泛性陆续参与抗体的化学反应、胃癌、新陈细胞代谢、转录、运动神经生态学学和电磁波等生理上问题步骤，特别的是在突触信息传递、后天性抗体的化学反应、GPCR和酪氨酸激酶电磁波和转录指数能力等业务领域的生理上问题干扰。棕榈酰化绘制行调节器靶标血清质的准确定位和能力，在提升血细胞准稳态中还具有至关根本的功用。诸如，抗体新陈细胞代谢糖血清质CD36，的一种清道夫多巴胺肾上腺素受体和皮脂含量酸易位酶，间歇CD36棕榈酰化将变更皮脂含量酸摄食、JNK/NF-κΒ电磁波，甚至会AMPK促活的皮脂含量酸β-氧化的，其或非乙醇性皮脂含量慢性乙肝有关的信息。

图2 棕榈酰化蛋白酶非常具有广泛性的生理问题印象

（图源：Saara-Anne Azizi, et al., Acc Chem Res, 2019）

03 、棕榈酰化与多种多样疾患相互影响

球核苷酸棕榈酰化在常见患病中的做用能先从酶的方素来论述，棕榈酰基转让酶DHHCs在好多菌物全过程中的做用早就树立，其介导的棕榈酰化失调症会造成一款型风险，哪些病症风险以组织化特情人的习惯会发生，如ZDHHC3、7、9、13和15参与者性到精神常见患病的疾患逻辑；ZDHHC7和20与胃癌有关的；ZDHHC1、5、11、13、21参与者性到代谢转化性常见患病；ZDHHC2、3、6、7、8、15、19和20参与者性到病毒性常见患病。

图3 棕榈酰基适当转移酶ZDHHCs结构特女性朋友的干预人类历史各种病

（图源：Lu Hu, et al., RSC Chem Biol, 2021）

1) 肿瘤

一点最关键性的胃癌晚期有关蛋清是被棕榈酰化突显的。这个经曲的典例是RAS氏族的小GTPases，HRAS、NRAS和KRAS-4A都要情况不可逆转地S-棕榈酰化，这对於产品定位质膜并也能图片转换组织细胞至关最关键性，决定的了装运和表现性质。另外问题，从更多方面的方向看下，Bailey抓捕将这段时间299个已校验的胃癌晚期动力分子与SwissPalm（这个蛋清棕榈酰化数据资料库）自动匹配，数据有79个(26%)的简码蛋清质是棕榈酰化的，说明了一种突显与胃癌晚期的有关性。

图4 大量胃癌驱动安装细胞全都棕榈酰化的

（图源：Pin-Joe Ko & Scott J Dixon, EMBO Rep, 2018）

上海交大许杰团队此前报道发现PD-L1棕榈酰化的存在，并对其进行了深入的功能和机制探究，这种修饰通过阻断PD-L1的泛素化来稳定PD-L1，从而抑制溶酶体对PD-L1的降解。并设计了一种竞争性的PD-L1棕榈酰化抑制剂，可降低肿瘤细胞中PD-L1的表达，以增强T细胞对肿瘤的免疫。这一研究为克服PD-L1介导的癌症免疫逃逸提供了新的策略。2022年4月，瑞士日内瓦大学的科学家Gonzalo P Solis等人也在《Nat Commun》中表示，血清质棕榈酰化一般变成 抗肿瘤抗癫痫药物的新靶点，相关结果在“Local and substrate-specific S-palmitoylation determines subcellular localization of Gαo”一文中。

图5 探究性PD-L1棕榈酰化的调空考核机制将益于癌症复发治疗方法

（图源：Han Yao, et al., Nat Biomed Eng, 2019）

2) 传播病症症状，以新冠实例

新冠蠕虫细菌是什么样本样本物体被顶层脂质双团伙层围住，之中具有刺激性SARS-CoV-2 S等膜血清，SARS-CoV-2 S有担当靶组织细胞运用和蠕虫细菌是什么样本样本构建。在蠕虫细菌是什么样本样本染病期間，SARS-CoV-2 S会发生的更多棕榈酰化遮盖，更是要格外重视是SARS-CoV-2 S少部分质网和高尔基身体里10个胞质半胱氨酸上会发生的如何快速棕榈酰化。进一次的研究分析反映出，SARS-CoV-2 S棕榈酰化在蠕虫细菌是什么样本样本包膜内行成含有碳水化合物的脂质结构设计域，棕榈酰化和脂质菌物合出有效途径提高网站新冠蠕虫细菌是什么样本样本的转染性性。该的研究分析跳转到棕榈酰化遮盖酶和脂质菌物合出酶是新抗蠕虫细菌是什么样本样本缓解靶点。 还有，SARS-CoV-2 S的棕榈酰化而对于合胞身形成和SARS-CoV-2假类病毒颗粒剂步入至关更重要。ZDHHC2、ZDHHC3、ZDHHC4、ZDHHC5、ZDHHC8、ZDHHC9、ZDHHC11、ZDFHC14、ZDHHC16、ZDHHC19和ZDHHC20的适度表述有利于了S的棕榈酰化，一些ZDHHCs被检测为与SARS-CoV-2 S相关。

图6 S-棕榈酰化控住SARS-CoV-2膜脂团队，开展傳染性

（图源：Francisco S Mesquita, et al., Dev Cell, 2021）

2021年，苏州大学生物医学研究院周芳芳教授课题组在Advanced Materials上发表了题为“Engineering Extracellular Vesicles Enriched with Palmitoylated ACE2 as COVID-19 Therapy”的研究论文，该研究发现血管紧张素转化酶2（ACE2，一种直接与SARS-CoV-2 S相互作用的关键受体）存在棕榈酰化修饰，且棕榈酰化对ACE2的膜靶向和胞外囊泡分泌至关重要。该研究设计了富含棕榈酰化ACE2的胞外囊泡，利用该囊泡饱和SARS-CoV-2 S作为病毒陷阱，抑制SARS-CoV-2的感染。

图7 设计丰富棕榈酰化ACE2的胞外囊泡用于制疗新冠肺气肿

（图源：Feng Xie, et al., Adv Mater, 2021）

3) 代谢率类疾病症状，以糖尿病的风险实例

2023年1月11日，美国华盛顿大学Clay F. Semenkovich团队在Cell Metabolism上发表了题为“Palmitoylation couples insulin hypersecretion with β cell failure in diabetes”的文章。该研究发现人体组织胰岛素的过量生产与棕榈酰化过程相关，这种棕榈酰化作用可被酰基蛋白硫酯酶1（APT1）逆转。通过棕榈酰化蛋白质组学发现，Scamp1是APT1的底物，定位于胰岛素分泌颗粒，敲低Scamp1会引起胰岛素分泌过多，促进β细胞衰竭，提示棕榈酰化参与糖尿病的发病过程。该研究不仅有助于理解糖尿病发病机制，同时为高风险人群提供了预防或延缓糖尿病的潜在靶点。

图8 棕榈酰化使血糖值高的患儿胰岛素排泌亢进与β血细胞衰退

（图源：Guifang Dong, et al., Cell Metab, 2023）

4) 面神经类重大疾病

棕榈酰化在运功脑神经系统系统元无线移动讯号电脑网络平台装设中的影响已被更加深入研发，D2多巴胺蛋白激酶(D2R)调整积极情绪和认同，与理念裂变症和帕金森综合症想关，Cys443是质膜删去必备的棕榈酰化位点，研发发掘D2R与DHHC3、DHHC4和DHHC8互为影响。ZDHHC9已被判断为运功脑神经系统系统的作用的要素调整要素，海马致力于物中较弱ZDHHC9引致树突的结构太短和限制性突触少。ZDHHC9就可以顺利通过介导Ras棕榈酰化提高卡ERK移动讯号通道。棕榈酰化Ras准确定位于质膜，提高卡中上游MAPK无线移动讯号移动讯号通道，引致树突萌发，ZDHHC9在运功脑神经系统系统电脑网络中平衡性性奋性和限制性无线移动讯号。ZDHHC9的作用退化变化引致棕榈酰化技术絮乱，将包含运功脑神经系统系统重要性病，如X连锁加盟认知能力困难(XLID)和羊癫疯。ZDHHC13已被说明在稳定难题重要性活动、运功的作用和脑子生物体能学管理方面发挥的作用要素影响。ZDHHC13的的作用不全变化引致还包括Drp1内的更多底物的低棕榈酰化技术。另外，ZDHHC13的作用困难也与排泄和退行性病想关。

图9 DHHC介导底物棕榈酰化突显，自我调节顺利病理报告功效

有此灵魂复氧（DHHC5）中的能力；面神经作用，如突触可发展性（DHHC5）；出现免疫力回应（DHHC21）；认知能力认知障碍（DHHC9）；结人体宫颈癌、肝组织癌和非小组织癌症（NSCLC；DHHC2）；和儿童白血病（DHHC9） （图源：Thomas Lanyon-Hogg, et al., Trends Biochem Sci, 2017）

04 、拜谱独特绘制——棕榈酰化绘制蛋清组

棕榈酰化淡化蛋白质组是对生物样品中的棕榈酰化位点/肽段进行全局无偏的定性定量分析，主要用于来探寻以上的症状有关的植物学学制度和靶标发展。拜谱生物作为国内首家提供该服务的公司，可以助力科研工作者开展多个领域的研究，以下是我公司该产品的特点：

1) ABE方案

棕榈酰化哪怕在1979年做出并于1980年在受损细胞培植中到印证，但论文检测蛋清质棕榈酰化的方法试炼很大程度上地拘束了该范围的进这一步研究方案，有一天21多世纪，跟随着酰基-生物技术素交换法（ABE）的产生，对该范围性能和控制的解释才有高效快速发展。ABE借助硫酯键的时好时坏定性处理将棕榈酰化被转化营生物技术素基团，还可以以半胱氨酸特异形的玩法观察动物底物棕榈酰化。

2) 顶目丰富性经验很丰富性，棕榈酰化位点评定量突破自我2万

拜谱生物棕榈酰化PTM平台拥有丰富的服务经验：在节肢动物组织结构和肿瘤细胞好项目中具有稳定优势，目前为多家高校和医院单位提供了细胞、卵巢、肿瘤、皮肤、乳腺、肝脏等样品的数据检测与分析服务，位点鉴定量最高可达2w+水平；在树种果肉和马蹄莲花的研究中也呈现出优秀的数据，如蕃茄花的位点鉴定量高达1w+。在病原菌病菌、病害害的研究中也不断积累经验，目前承接过的样品类型有稻瘟菌菌丝、稻曲菌等。

图10 拜谱海洋生物棕榈酰化掩盖蛋清组的区域的项目工作经验

3) 靶标发展与核实“站台式”定性分析

在疾病标志物检测、药物开发、生物信号通路研究中，我们推荐组合方案：棕榈酰化表达球蛋白组+棕榈酰化PRM认证，一站式解决靶标发现与验证。

4) 类型、多样的半胱氨酸装饰组

蛋白质中的半胱氨酸是一个极其活跃的残基，可以进行多种翻译后修饰，因此除棕榈酰化修饰语淀粉酶组检测以外，我们还可提供亚硝基化、谷胱甘肽化和Total 腐蚀完美重现装饰球蛋白组分析，以及次磺酸化和巯基化正在开发测试中。

5) 送样意见建议

参阅文献综述：

[1] Lanyon-Hogg T, Faronato M, Serwa RA, Tate EW. Dynamic Protein Acylation: New Substrates, Mechanisms, and Drug Targets. Trends Biochem Sci. 2017;42(7):566-581. doi:10.1016/j.tibs.2017.04.004

[2] Azizi SA, Kathayat RS, Dickinson BC. Activity-Based Sensing of S-Depalmitoylases: Chemical Technologies and Biological Discovery. Acc Chem Res. 2019;52(11):3029-3038. doi:10.1021/acs.accounts.9b00354

[3] Hu L, Tao Z, Wu X. Insights into auto-S-fatty acylation: targets, druggability, and inhibitors. RSC Chem Biol. 2021;2(6):1567-1579. Published 2021 Aug 25. doi:10.1039/d1cb00115a

[4] Ko PJ, Dixon SJ. Protein palmitoylation and cancer. EMBO Rep. 2018;19(10):e46666. doi:10.15252/embr.201846666

[5] Yao H, Lan J, Li C, et al. Inhibiting PD-L1 palmitoylation enhances T-cell immune responses against tumours [published correction appears in Nat Biomed Eng. 2019 May;3(5):414]. Nat Biomed Eng. 2019;3(4):306-317. doi:10.1038/s41551-019-0375-6

[6] Mesquita FS, Abrami L, Sergeeva O, et al. S-acylation controls SARS-CoV-2 membrane lipid organization and enhances infectivity. Dev Cell. 2021;56(20):2790-2807.e8. doi:10.1016/j.devcel.2021.09.016

[7] Xie F, Su P, Pan T, et al. Engineering Extracellular Vesicles Enriched with Palmitoylated ACE2 as COVID-19 Therapy. Adv Mater. 2021;33(49):e2103471. doi:10.1002/adma.202103471

[8] Dong G, Adak S, Spyropoulos G, et al. Palmitoylation couples insulin hypersecretion with β cell failure in diabetes. Cell Metab. 2023;S1550-4131(22)00549-6. doi:10.1016/j.cmet.2022.12.012